Digital Biology

アラインメント

簡単にDNA、プロテインのシーケンスアラインメントができます。
アラインメントボタンをクリックし、アルゴリズムを選択するだけです。

アラインメントの綺麗なビジュアルと編集

  • ・アノテーションの表示と編集を同時に
  • ・ドラッグでGapの追加、削除
  • ・不要なカラムは非表示に設定可能。
  • ・アラインメント内にダイレクトに塩基をタイピングして編集
  • ・コールの校正
  • ・翻訳情報の表示・色付けでCDSの確認
  • ・アラインメント情報を利用して系統樹を表示
  • ・選択したシーケンス部分の統計情報の表示

ClustalW, MUSCLE, MAFFTなど様々なアラインメントツールを一つのフレームワークで

プログラムからプログラムへと飛ぶことがなくなり、時間を節約できます。
Geneiousには下記のアラインメントが入っています。

  • ・The Geneious Aligner
  • ・ClustalW
  • ・MUSCLE
  • ・ローカルリアラインメント
  • ・ペアワイズアラインメント
  • ・Translation Align
  • ・Consensus Align
  • ・MAFFT- プラグインとして利用可
  • ・MAUVE- プラグインとして利用可
  • ・LastZ - プラグインとして利用可

アノテーション

どのアラインメントを選択しても、データの編集やアノテーションをお好みで行えます。