Geneious

アセンブリ&マッピング

インターネットの画面を見ながら悩むことはもうありません。同じような手順でシーケンスアセンブリとリファレンスマッピングが行えます。
最適化されたアルゴリズムと綺麗なインターフェースでアセンブリをお楽しみ下さい。

信用度の高いリファレンスマッピング

Geneiousのリードマッパーは一つの場所、一つのフレームワークを使用するため、他のマッピングアルゴリズムよりも良い結果が期待できます。

White paperを読む
http://assets.geneious.com/documentation/geneious/GeneiousReadMapper.pdf

De Novoアセンブリ、ゲノムアセンブリ

Geneious Assemblerを使えば、間違った塩基や短いIndelを含むリードエラーに柔軟に対応できます。
様々なNGSマシン、様々な長さのリード、異なるマシン由来のリードのミックスですら扱えます。

  • ・時間と正確性に基づいたお好きなアセンブリ方法を選択
  • ・クオリティを上げるためのリードの末端の除去
  • ・アセンブリレポートの保存
  • ・最小のオーバーラップの設定
  • ・短めのショートリードのDe novoアセンブリ用にVelvetプラグインを用意

デスクトップNGS

どのようなデータでもGeneiousであればアセンブルすることができます。
454,Sanger,SOLiD, Illuminaのデータが一度にアセンブルできます。
異なるスペーサーサイズのペアエンド、サンガーシーケンス由来のクロマトグラムにも対応。
更に、Geneiousにインポートした後は、動きの軽いGenome Browserで生のNGSデータ、コンティグアセンブリを見ることができます。

Geneiousのマッピング、カバレッジ