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Digital Biology

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パスウェイ解析IPA 一分子リアルタイムDNAシークエンサーPacBio RSII/Sequel System 標識抗体・試薬BioLegend
バリアントデータ解析ツールVariant Analysis 高速細胞イメージングシステムCeligo DNA精製キットPrinceton(プリンストン)
ヒト遺伝子変異データベースHGMD® Professional 細胞自動カウント・生死判別Cellometer(セロメーター) エンドペプチターゼPrinceton(プリンストン)
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ホーム > 製品情報 > 【ソフトウェア】 Variant Analysis

Variant Analysis

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特長

Variant Analysisの特徴

Ingenuity® Variant AnalysisTM はヒトのリシーケンシングデータより得られる膨大なVariantデータを解析するツールです。
Variantデータを絞り込む解析ツールと、バイオロジカルな絞り込みツールが統合されたWebツールとなっております。
Variant AnalysisTMを利用することで莫大なVariantから研究テーマと合致する少数のVariantまでドリルダウンする事ができます。

疾病モデル – 肺癌と関連するVariantは?
バイオマーカ – どのVariantが化合物と関連しているか?
パスウェイ – どのVariantがパスウェイと関連しているのか?
など様々な条件でVariantを絞り込めます。

youtube

  • 家系解析
    メンデルの遺伝法則にしたがったバリアントを見つけられます

  • 病気の特定
    臨床情報やMedical genomesで有害なバリアントに関連する病気を見つけられます

  • 統計検定
    あるグループで他のグループよりも有害なバリアントを持つ遺伝子やパスウェイを見つけ出せます

もっと詳しくVariantAnlysisの特徴を見る(英語)

  • 短時間で結果を取得
    数か月かかる解析でも、数時間で重要なバリアントを特定できます

  • ナレッジを元に解析
    専門家によりキュレートされたバイオメディカル文献由来の知見を使用し、重要なバリアントを見つけ出していくことができます

  • 使いやすいインターフェース
    バイオインフォマティクスの経験が無くても、Webブラウザ内で簡単に解析を行えます

  • 拡張性と安全性
    安全なWebアプリケーション上で、がんや遺伝などの解析から、数千サンプルでのアソシエーション解析まで行って頂けます

  • 簡単に使用可能
    Webベースで動くため、ソフトウェアのインストールやデータベースのアップデートは一切要りません

対応データ: ヒトの下記フォーマットのVariantデータファイル

・VCF 4.x フォーマット(http://www.1000genomes.org/node/101)
・Complete Genomicsフォーマット
・GVFフォーマット
でchromosome、position、reference allele (ヒトリファレンスゲノム由来)、alternate allele (サンプル由来)、variant call quality、genotype (heterozygous or homozygous)が含まれているデータ、更にオプショナルデータとしてread depthが利用可能です。

Variant Analysisの動作環境

Variant Analysisの仕様・動作環境

Adobe Flash Player 10.2以降
対応ブラウザ Windows
Internet Explorer 9以降
Firefox 6以降
Chrome18以降
Mac
Safari 5以降
Firefox11以降
Chrome18以降

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