NGSデータの2次解析を高速化
WASAI Lightning™はNGSデータの2次解析を高速化するオールインワンソリューションです。従来のCPUベースの手法では30時間かかる2次解析をWASAI Lightning™を 用いることで6時間半に短縮できます。パイプラインとしてBWAアライメント、GATK Variant Callが実装されています。WASAI Lightning™の高い処理能力を利用する ことでNGSデータの解析にかかるコストと時間が節約可能となります。
オールインワンNGS2次解析ソリューション
コマンドラインは不要
WASAI Lightning™はウェブブラウザーで操作し、解析の実行、解析結果のダウンロードなどが可能です。
*コマンドラインでの解析実行も可能です。
Lightning-bwaはBWA-MEMアルゴリズムをFPGA用に最適化し、頻繁なメモリアクセスの問題を克服するために、メモリ階層とパイプライン設計の最新技術を実装しました。
Time-Saving
Lightningを使用することで体細胞変異解析にかかる時間が30時間から6.5時間へと23時間以上短縮されます。この効率化によってTCO（総保有コスト）が低減されます。
Multiple Applications
Lightningソリューションに最適化されたBWA+GATKアルゴリズムを使用することで ホールゲノムシークエンス、エクソームシークエンスなど様々な解析に対応します。
All-in-one pipeline
FPGAカード搭載済みサーバーとして提供されるため簡単に設置、運用が可能です。
Accuracy ＆ Consistency
Lightningソリューションに最適化されたアルゴリズムを使用しますが、検出される SNPs、InDelsや精度はオリジナルのアルゴリズムと同等となります。
サーバーおよびFPGAスペック
| サ―バー形状 | 2U ラックマウント™ |
|---|---|
| プロセッサー | Intel® Xeon® スケーラブルプロセッサー Intel® Arria® 10GX 1150 F34パッケージ |
| メモリ | 128GB |
*最新の仕様はお問い合わせください
NGS解析サーバーシステム WASAI Lightning™のカタログを請求する
NGS解析サーバーシステム WASAI Lightning™の関連商品
-
ヒト遺伝子変異データベース
HGMD® Professional
HGMD® はヒトの遺伝子の変異情報と関連する疾患を網羅的に登録しているデータベースです。登録遺伝子数、および遺伝子あたりの変異の登録数の豊富さ、マニュアルキュレーションによるデータの信頼性を兼ね備えています。
-
NGSライブラリ調製関連キット
Swift Biosciences™
Swift Biosciences™社は Illumina® シークエンサー、Ion Torrent™ シークエンサーあるいはPacBio®シークエンサー向けの、ユニークなライブラリ調製用キットを提供しています。ユニークなライブラリ調製技術により、様々なタイプのDNAから効率よくシークエンスデータの取得が可能です。他社キットではあきらめていた解析にも、可能性が広がります。
