Introduction: BLAST検索

シーケンスは共通の祖先から長い時間をかけて進化してきました。新しいシーケンスを同定するには、新規シーケンスの機能の同定に役立つような近縁なシーケンスを見つけられるアラインメント方法を用いて、シーケンスと他の既知のシーケンスを比較するという方法が考えられます。

シーケンスアラインメントに関してはこちらをご参照下さい。

BLAST検索はクエリーシーケンスの取得と、データベース内の各シーケンスとクエリーシーケンスの比較から成り立ちます。GeneiousではNCBIから供給される外部データベースを検索したり、ご自分の手持ちのシーケンスから作成したカスタムデータベースを検索したりすることが可能です。BLAST検索の結果には、相同性によってランク付けされた潜在的に近縁なシーケンスのセットが出てきます。

Section 1: 1つのシーケンスのBLAST検索

Section 2: 結果の見方

Section 3: バッチ検索

Section 4: 検索オプション