高速Variant CallシステムWASAI Lightning™
WASAI Lightning™最新情報INFORMATION
NGSデータの2次解析を高速化
WASAI Lightning™はNGSデータの2次解析を高速化するオールインワンソリューションです。従来のCPUベースの手法では30時間かかる2次解析をWASAI Lightning™を 用いることで6時間半に短縮できます。パイプラインとしてBWAアライメント、GATK Variant Callが実装されています。WASAI Lightning™の高い処理能力を利用する ことでNGSデータの解析にかかるコストと時間が節約可能となります。
オールインワンNGS2次解析ソリューション
コマンドラインは不要
WASAI Lightning™はウェブブラウザーで操作し、解析の実行、解析結果のダウンロードなどが可能です。
※コマンドラインでの解析実行も可能です。
Lightning-bwaはBWA-MEMアルゴリズムをFPGA用に最適化し、頻繁なメモリアクセスの問題を克服するために、メモリ階層とパイプライン設計の最新技術を実装しました。
Time-Saving- Lightningを使用することで体細胞変異解析にかかる時間が30時間から6.5時間へと23時間以上短縮されます。この効率化によってTCO（総保有コスト）が低減されます。
Multiple Applications- Lightningソリューションに最適化されたBWA+GATKアルゴリズムを使用することで ホールゲノムシークエンス、エクソームシークエンスなど様々な解析に対応します。
All-in-one pipeline- FPGAカード搭載済みサーバーとして提供されるため簡単に設置、運用が可能です。
Accuracy ＆ Consistency- Lightningソリューションに最適化されたアルゴリズムを使用しますが、検出される SNPs、InDelsや精度はオリジナルのアルゴリズムと同等となります。
サーバーおよびFPGAスペック
| サ―バー形状 | 2U ラックマウント™ |
|---|---|
| プロセッサー | Intel® Xeon® スケーラブルプロセッサー Intel® Arria® 10GX 1150 F34パッケージ |
| メモリ | 128GB |
※最新の仕様はお問い合わせください
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