NGSライブラリ調製関連キットSwift Biosciences™

Swift Biosciences™社はillumina®シークエンサー、PacBio®シークエンサーあるいはIon Torrent™ シークエンサー向けの、ユニークなライブラリ調製関連商品をご提供しています。
革新的な技術により、様々なタイプのDNA/RNAから効率よくライブラリ調製が可能です。他社キットではあきらめていたサンプルに、もう一度チャレンジしてみませんか? お客様の「あとすこし… 」を叶えます。

Swift Biosciences™社商品のココに注目!

Accel-NGS®シリーズ

革新的なAdaptase®テクノロジー

一本鎖DNAに対してアダプター配列を付加する技術です。二本鎖DNAは熱変性後、一本鎖にしてから使用します。
この付加されたアダプターを起点として相補鎖合成を行い、最終的には二本鎖ライブラリとして完成させます。最初の反応には酵素Adaptase®を用いることから「Adaptase®テクノロジー」と呼ばれます。一本鎖DNAウイルスや熱変性した病原体サンプル、ニックや損傷あるいは短いフラグメントを含む二本鎖DNAサンプルからのライブラリ調製に適しています。

  • 高いライブラリ収率により、貴重なサンプルを最大限有効に活用できます。
  • 40bpからのインサート長に対応しています。古代DNAの解析にも最適です。
  • 1st strand cDNAから直接、strand情報を維持したライブラリ調製が可能です。

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汎用性の高い2Sテクノロジー

二本鎖DNAに対してアダプター付加反応を5’側と3’側で別々に行う独自のワークフローにより、ライブラリ調製する技術です。
片側ずつ別々に反応を行うことでアダプターダイマーの生成が抑えられ、ユニークで機能的なライブラリ分子を得ることができます。また、Index Hoppingを避ける効果もあります。シングルチューブによるワークフローは、各ステップでのサンプルロスを最小限に抑え、結果として少量のDNAからスタートしても十分量のライブラリを確保することができます。

  • 微量サンプルでもアダプター濃度の最適化が不要で、アダプターダイマーの心配がありません。
  • AT-/GC-rich な領域を保持したままのライブラリ調製が可能です。
  • 1本チューブによるワークフローは作業中のサンプルロスを最小限に抑え、高いライブラリ収率を実現します。
  • 最大で768種のインデックスが利用可能です。

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Swift 2S® Turboテクノロジー

二本鎖DNAからライブラリ調製する技術です。 酵素によるgDNA断片化から末端修復までをワンステップで行い、引き続きアダプター付加を行います。TurboおよびTurbo Flexibleの2種類のキットをご用意しています。

  • Swift 2S® Turbo:50ng以上のヒトgDNAに対応しています。最大で768種のインデックスが利用可能です。ライブラリの完成にはPCRが必須です。
  • Swift 2S® Turbo Flexible:1ng以上のヒトgDNAに対応しています。illumina®社のTruSeqアダプターを利用します。PCRフリーでライブラリを完成させることができます。

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Swift 2S® SONIC

断片化済み二本鎖DNAのNGSライブラリ調整を効率化、低価格化します。

  • Covaris®での断片化DNAとの互換性を持つキットです。
  • 1 ngから1 µgのインプットDNAをサポート(PCRフリーの場合50ng)します。
  • 簡便で迅速な2ステップワークフローで、自動化システムに対応し、Swift Normalase®との互換性があります。
  • 低コストでライブラリ調製が可能です。

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Swift Hybridization Capture Kits

ヒト研究向けのターゲットキャプチャキットです。ハイブリダイゼーションにかける時間は4~16時間の間で調整が可能です。16反応分の小さなキット構成で、バッファー類も別売なので、トライアルのハードルが低いのが特徴です。

  • エキソンパネル・がんパネル・遺伝性疾患パネルをご用意しています。
  • Swift Biosciences™社のユニークなライブラリ調製キットと豊富なアダプター種から、お好きなものと組み合わせて使用できます。

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Swift Normalase® テクノロジー

独自の酵素テクノロジーにより、プールした各ライブラリの濃度を4nMとなるように調製するためのキットです。定量PCR工程の置き換えが可能で、多検体処理に最適です。

  • フルレングスのアダプター付加後に行うPCR工程をNormalase PCRに置き換える、簡便なワークフローです。
  • 本商品はSwift Biosciences™社製品をお使いの方はもちろん、他社キットをお使いの方にもご利用いただけます。

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Swift Normalase® アンプリコンパネル (SNAP)

複数のオーバーラップしたアンプリコンを用い1チューブ内で最速2時間のワークフローでライブラリ調製が可能です。

  • PCR1+PCR2ワークフローにより少量のインプットからでも安定したNGSライブラリを調製可能です。
  • qPCR不要、ライブラリは付属のSwift Normalase®試薬を使用してノーマライズ可能です。(Qubit®,Agilent Bioanalyzerなどの既存方法での定量も可能)

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ヒト研究用アンプリコンパネル

臨床的に関連のある変異を検出、スクリーニングするための、主にillumina®シークエンサー用のパネルシリーズです。マルチプレックスアンプリコンターゲットの生成およびインデックスアダプター付加という2段階の反応を、1本のチューブで行うワークフローです。最大96種類のインデックス付加ライブラリが作製でき、1回のシークエンスランでマルチプレックス解析をすることが可能です。

  • あらかじめデザインされたコアパネルを組み合わせて、カスタムデザインにより拡張性を持たせることができます。
  • 専用の解析ツールをご用意しています。

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商品ラインアップ

illumina®プラットフォーム用ライブラリ調製キット

キット分類 製品名 詳細 インデックスオプション
Tru Seq MID 768 plex UDI Normalase®
  Adaptase®
テクノロジー
Swift RNA Library Kit 1st strand cDNAからstrand情報を維持したまま、直接ライブラリ調製を!(幅広いRNA品質に対応)   2
Swift Rapid RNA Library Kit 1st strand cDNAからstrand情報を維持したまま、直接ライブラリ調製を!(高品質RNAに対応)   2
ACCEL-NGS® Accel-NGS® 1S Plus DNA Library Kit 1本鎖DNAや、ニックや損傷あるいは短いフラグメントを含む2本鎖DNAからのライブラリ調製に。     2
Accel-NGS® Methyl-Seq DNA Library Kit バイサルファイト処理されたDNAサンプルの回収率を最大限に高め、より正確にサンプル組成を反映するライブラリ調製を可能に。     2
Accel-NGS® Adaptase® Module 最大384種のインデックスで、Single-cellメチル化解析を効率よく。 3種のインデックスを組み合わせて384plexを達成
2S
テクノロジー
Accel-NGS® 2S PCR-Free DNA Library Kit 100ngからのPCRフリーライブラリの調製に。     1,2
Accel-NGS® 2S Plus DNA Library Kit(MID対応) 10pg-250ngの幅広いインプットDNA量に対応。 1,2
Accel-NGS® 2S Hyb DNA Library Kit(MID対応) SureSelectXT ・ SureSelectXT2・IDT xGen® Lockdown®・NimbleGen™と組み合わせたターゲットシークエンスに。     2
Swift
2S®
Turbo
Swift 2S® Turbo DNA Library Kit gDNAの断片化からアダプター付加まで、一気にアプローチ(PCR必須)   2
Swift 2S® Turbo Flexible DNA Library Kits gDNAの断片化からアダプター付加まで、一気にアプローチ(PCRフリーに対応)       1,2
Swift 2S® SONIC Swift 2S® Sonic DNA Library Kit 断片化DNAをインプットとする汎用性の高いキット   1,2

Normalase®はすべてのSwift Biosciences™社キット、および他社キットにより調製したライブラリで使用できますが、アダプター付加の方法によりプロトコルが異なります。
Normalase®をお使いの場合には、PCRフリーにはできません。詳細はお問い合わせください。

  • パターン1:完全長アダプターをライゲーションにより付加する場合。完成したライブラリに対してNormalase PCRを行います。
  • パターン2:不完全長アダプターをライゲーションにより付加し、インデックスPCRによりライブラリを完成させる場合。専用のIndexing PrimerによりNormalase PCRを行います。

illumina®プラットホーム用ヒト研究ターゲットキャプチャキット

キット分類 製品名 詳細
エキソンパネル Swift Exome Hyb Panel 19,396種のcoding遺伝子を基にデザインしたExomeパネル。
がんパネル Swift Pan-Cancer Hyb Panel 12種類の腫瘍に関連した、127種類の遺伝子に対してデザインしたパネル。
遺伝性疾患パネル Swift Inherited Diseases Hyb Panel HGMD®に基づいた、4,503種類の遺伝子に対してデザインしたパネル。

illumina®プラットホーム用ライブラリ標準化キット

キット分類 製品名 詳細
ライブラリ標準化キット Swift Normalase® Kit 定プールした各ライブラリの濃度を4nMとなるように調製するためのキット。定量PCRの置き換えに最適。

その他のプラットフォーム用ライブラリ調製キット

キット分類 プラットフォーム 製品名 詳細 インデックス
オプション
ACCEL-NGS® Adaptase®
テクノロジー
IonTorrent™ Accel-NGS® Library Kit for Ion Torrent 5ngからPCRフリーでライブラリ調製可能な、唯一のキット。 Ion Set A/B
2S
テクノロジー
PACBIO Accel-NGS® XL Library Kit for Pacific Biosciences® わずか2μgのDNAインプット量からのライブラリ調製を実現。SMRTbell Express Template Prep Kitと同等の利便性をRSIIユーザー様にもご提供。  

illumina®プラットフォーム用Normalase® アンプリコンパネル (SNAP)

キット分類 製品名 詳細
微生物研究パネル 16S Primer Pool v2 すべての16S rRNA可変領域をカバー。
ITS1 Primer Pool ITS1をカバー。
SARS-CoV-2研究パネル SNAP SARS-CoV-2 Panel with Additional Genome Coverage 全ゲノム(NC_045512.2)の99.7%をカバー。
SARS-CoV-2 Panel 全ゲノム(NC_045512.2)の98.8%をカバー。
ACE2 Gene Panel Primer Pool コーディング領域の全域をカバー。
ヒト疾患研究パネル Colorectal Primer Pool 16種類の大腸がん関連遺伝子のホットスポットをカバー。
Lynch Syndrome Primer Pool リンチ症候群に関する生殖細胞4遺伝子(MLH1・MSH2・MSH6・PMS2)を検出対象に。
Lung Primer Pool 小細胞性肺がんおよび非小細胞性肺がんに関連した17遺伝子のホットスポットをカバー。
Myeloid Primer Pool 急性骨髄性白血病(AML)・骨髄異形成症候群(MDS)・骨髄増殖性腫瘍(MPN)に関連した23遺伝子のホットスポットをカバー。
CFTR Primer Pool 嚢胞性線維症の新生児スクリーニングを簡便に。
Sample_ID Primer Pool がん研究に信頼できるサンプルトラッキングを。
56G Oncology Primer Pool v2 56種類の臨床的に意義のある腫瘍関連遺伝子にあるホットスポットをカバー。
57G Pan-Cancer Profiling Primer Pool 57種類の腫瘍関連遺伝子を包括的に解析。あらゆる研究プロジェクトのとりかかりに最適。
Comprehensive TP53 Primer Pool TP53遺伝子のコーディング領域全体を検出対象としている唯一のキット。
BRCA1 and BRCA2 Primer Pool 両BRCA遺伝子の全コーディングエキソンをカバー。
BRCA1, BRCA2, and PALB2 Primer Pool 両BRCA遺伝子に加えて、PALB2遺伝子までカバー。

illumina®プラットホーム用アンプリコンライブラリ調製キット

キット分類 製品名 詳細
微生物研究パネル Swift Amplicon® 16S+ITS Panel すべての16S rRNA可変領域と、ITS1およびITS2を対象として含んでいます。
ヒト疾患関連パネル Accel-Amplicon® Plus Colorectal(CRC) Cancer Panel 16種類の大腸がん関連遺伝子のホットスポットをカバー。
Accel-Amplicon® Plus Lynch Syndrome Panel リンチ症候群に関する生殖細胞4遺伝子(MLH1・MSH2・MSH6・PMS2)を検出対象に。
Accel-Amplicon Plus Lung Cancer Panel 小細胞性肺がんおよび非小細胞性肺がんに関連した17遺伝子のホットスポットをカバー。
Accel-Amplicon® Plus Myeloid Panel 急性骨髄性白血病(AML)・骨髄異形成症候群(MDS)・骨髄増殖性腫瘍(MPN)に関連した23遺伝子のホットスポットをカバー。
Accel-Amplicon® CFTR Panel 嚢胞性線維症の新生児スクリーニングを簡便に。
Accel-Amplicon® Sample_ID Panel がん研究に信頼できるサンプルトラッキングを。
Accel-Amplicon® 56G Oncology Panel v2 56種類の臨床的に意義のある腫瘍関連遺伝子にあるホットスポットをカバー。
Accel-Amplicon® 57G Plus Pan-Cancer Profiling Panel 57種類の腫瘍関連遺伝子を包括的に解析。あらゆる研究プロジェクトのとりかかりに最適。
Accel-Amplicon® Comprehensive TP53 Panel TP53遺伝子のコーディング領域全体を検出対象としている唯一のキット。
Accel-Amplicon® BRCA1 and BRCA2 Panel 両BRCA遺伝子の全コーディングエキソンをカバー。※
Accel-Amplicon® BRCA1, BRCA2, PALB2 Panel 両BRCA遺伝子に加えて、PALB2遺伝子までカバー。※
Accel-Amplicon® EGFR Pathway Panel 『EGFR遺伝子』の連続した領域に加えて、3遺伝子(BRAF・KRAS・NRAS)のホットスポット領域を検出対象に。
Swift Amplicon®(HS)EGFR Pathway (Panel) 『EGFR遺伝子』の連続した領域に加えて、3遺伝子(BRAF・KRAS・NRAS)のホットスポット領域を検出対象に。MID(分子インデックス)の利用で低頻度変異解析にも。

研究用にのみ使用できます。診断目的およびその手続き上での使用はできません。
※にはIon Torrent™対応商品もございます。詳細はお問い合わせください。
Swift Biosciences™、同社のロゴはSwift Biosciences™社の商標です。その他全ての商標はそれぞれの所有者に帰属します。

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