インジェヌイティー パスウェイ アナリシス 「IPA」の特徴
IPAは論文等により得られた相互作用、生物学的機能、疾病情報、薬剤情報等がデータベース化されたソフトウェアで、ユーザーの遺伝子、タンパク、代謝産物リストを用いたネットワーク、機能解析や分子、相互作用等の辞書として使用可能です。
2010年10月現在IPAの論文引用数は累計3,506に達しています。これらの論文はIngenuity社のWebサイトからもご確認いただけます。
■累計引用論文数
「IPA」の遺伝子、タンパク、代謝産物リストの解析
IPAのナレッジを活用した解析
IPAのナレッジを活用した解析
GeneSpringGX、RosettaResolver、Spotfireとの連携機能により、IPAへの発現情報等のアップロード、IPAで絞り込んだ分子情報の各ソフトへの取り込みという双方向のやり取りが可能です。
2010年1月現在
遺伝子数
| ヒト | 約17,000個 |
| マウス | 約12,400個 |
| ラット | 約7,200個 |
FDA認可及び臨床試験中の薬剤
約2,900個
インジェヌイティー収集の相互作用数
約2,500,000相互作用
外部データベース由来の相互作用数
約300,000相互作用
既知のパスウェイ情報
360Pathway
ホモログ対応の生物種
（各社アレイID）
シロイヌナズナ｜ウシ｜線虫｜チキン｜チンパンジー｜ゼブラフィッシュ｜イヌ｜キイロショウジョウバエ｜アカゲザル｜出芽酵母｜分裂酵母
右記の著名ジャーナルを含む500以上のジャーナルからヒト、マウス、ラットの分子生物、遺伝子、遺伝子産物、低分子情報をPhD.クラスの科学者により全文（図表も含む）から抽出し、さらにインジェヌイティー独自のオントロジーによりデータベース化しています。さらに広範囲な論文から人手によりレビューされた自然言語処理によって抽出されたナレッジも収集されています。
- American J. Pathology
- Arteriosclerosis, Thrombosis and
Vascular Biology - Biochemistry
- Blood
- Cancer Research
- Cell
- CurrentBiology
- Development
- EMBO
- European J. of Immunology
- FASEB Journal
- Genes and Development
- Hypertension
- Immunity
- J.Biological Chemistry
- J.Cell Biology
- J.Experimental Medicine
- J.Immunology
- J.Lipid Research
- J.National Cancer Institute
- J.Neuroscience
- Molecular and Cellular Biology
- Molecular Biology of the Cell
- Molecular Cell
- Nature
- Nature Cell Biology
- Nature Genetics
- Nature Medicine
- Neuron
- Oncogene
- Proc. National Acad. Sciences USA
- Science
IPAの仕様・動作環境
対応ID
- Affymetrix (Expression, SNP)
- Agilent
- Applied Biosystems
- Codelink
- db SNP –NCBI
- Entrez Gene
- Ensemble ID
- GenBank
- GenPept
- GI Number
- HMDB
- HUGO Gene Symbol
- Illumina
- International Protein Index
- KEGG
- miRBaseID -Sanger
- PubChem CID
- RefSeq
- UniGene
- UniProt/Swiss-Prot
- UCSC
| Platform | OS | Webブラウザ | Javaのバージョン* |
|---|---|---|---|
| PC | Windows XP SP3 | IE6.0, 7.0, 8.0 Firefox1.5, 2.0, 3.0 | JRE 1.5.0_06, JRE 1.6.0_18 (推奨) |
| PC | Vista | IE 7.0, 8.0 | JRE 1.5.0_x, JRE 1.6.0_18 (推奨) |
| PC | Windows 7 | IE8 Firefox3.6 | JRE 1.6.0_21 |
| Mac | 10.5.8 | Safari 5.0.2 | 1.5.0_26 |
| Mac | 10.6.4 | Safari 5.0.2 | 1.5.0_22 |
| 開発元 | 米国 インジェヌイティーシステムズ社 URLhttp://www.ingenuity.com | ||
- *WindowsはJRE1.6.0_18を推奨
- ディスプレイ解像度1280×1024以上を推奨
- CPU1.5GHz以上、メモリ1GB以上（Vistaは2GB以上）を推奨
IPA（インジェヌイティー パスウェイ アナリシス）のカタログを請求する
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マイクロアレイデータ解析
GeneSpringGX
GeneSpringGXはマイクロアレイやReal-Time PCRの数値解析・生物学的解析等、様々な機能を搭載したデータマイニングソフトウェアです。 数値的な遺伝子の絞込みのみに留まらず、GSEA・GeneOntology・パスウェイ・ゲノムブラウザのような充実の生物学的解析機能が付加されております。
siRNA/miRNA合成、バリデーションサービス
Genolution Pharmaceuticals
Genolution Pharmaceuticalsではターゲット遺伝子あるいはシーケンスを伝えていただくだけで、最適なsiRNA、miRNA配列を選定し、合成いたします。
siRNA合成保証付＋ノックダウン検証キットや、選定したsiRNA、miRNA配列のバリデーション作業を伴った合成サービスも行っております。
