近接ライゲーションテクノロジーDovetail Genomics®

Dovetail® LinkPrep™ テクノロジー​

1アッセイで複数のアプリケーションに対応

Dovetail® LinkPrep™ テクノロジーは、長距離ゲノム情報を取得するリンクリードライブラリを作製します。
このアプローチは、包括的なゲノム変異の検出、3Dゲノム構造のマッピング、ハプロタイプを考慮したゲノムアセンブリの作成など、幅広いアプリケーションを容易にします。​

1回の実験でより多くのことを、より短い時間で実現

Dovetail® LinkPrep™アッセイは、効率的なワークフローにより、シークエンス解析に対応したIllumina®用ライブラリーを1 日で作成できます。使いやすさを重視して設計されたこのプロトコルは、標準的な分子生物学の知識があれば誰でも利用でき、特別な専門知識は必要ありません。LinkPrep™ワークフローは自動化に対応しております。

ゲノム全体にわたる均一なカバレッジ​

LinkPrep™テクノロジーは、制限酵素に基づく配列バイアスによって生じる、従来のHi-Cデータの広範囲にわたる非ポアソン分布と比較して、均一なゲノムカバレッジを実現します。
向上したカバレッジ(緑色の曲線)は、構造変異やクロマチン相互作用のより高解像度かつ高精度な検出を可能にするアッセイの能力を明確に示しています。この機能により、複雑なゲノム領域をより明確に理解することができ、データからより有意義な知見を引き出すことが可能になります。​

Dovetail® LinkPrep™ のアプリケーション例​

For Genome Assembly

ゲノムスキャフォールディング​

ハプロタイプ解決アセンブリ

ポリプロイドアセンブリ​

ハプロタイプを解決したアセンブリも可能に​
Table A. Dovetail® LinkPrep™ データをDovetail® HiRise® を使用してアセンブルした魚類ゲノムの完全性スコア

Figure B. 魚類2倍体ゲノムのハプロタイプ分解アセンブリのコンタクトマトリクス

For Epigenetics

3D Genomics

TAD/LOOP

Chromatin Structure

Transcription Factor Dynamics

SNV/VUS Annotations

偏りのないゲノムカバレッジは解析精度の向上につながります

不均等なシークエンスカバレッジはLoopの位置をシフトさせてしまいます​​

プロモーター領域をターゲッティング、エンリッチした解析も可能​

Dovetail Targeted Enrichment キットと LinkPrep™ を組み合わせることで、プロモーター-エンハンサーやプロモーター-プロモーターコンタクトなどのプロモーター特異的な相互作用を高解像度に、かつ低シークエンスコストにて解析することが可能です。​

Targeted Enrichment キットはこちら

For Genetic Variation

Variant

HLA Typing

Somatic Variant Detection

これまでの分子的アプローチでは非常に困難だった網羅的な構造変異の検出をDovetail® LinkPrep™で網羅する​​

これまでの技術では、検出可能なサイズ範囲や複雑さの異なる遺伝的変異を検出する能力にギャップがあり、結果として、サンプル内のすべての遺伝的変異を網羅的に検出するためには、複数の異なる技術を組み合わせる必要がありました。​
LinkPrep™ソリューションは、イルミナのショートリードシークエンシングプラットフォームによる単一のNGSアッセイのみですべての遺伝的変異を網羅的に検出することができます。​​

完全なソリューション – サンプルから洞察へ​

Dovetail が提供するデータ解析ツール 【Dovetail Analysis Portal】 は、Dovetail®のリンクリードライブラリから生成されたNGS FASTQファイルの解析を効率的に行うことができるクラウドベース解析ツールです。体細胞変異検出(ヒト)およびエピジェネティック特徴検出(ヒトおよびマウス)に対応したワークフローから選択でき、バイオインフォマティクスの設定は不要です。インタラクティブなサマリーレポートと、すぐに使用できる明確な結果をダウンロードすることができます。​​

■Epigenetic Feature Calling / Differential Analysis | ヒト・マウス 用   ■Somatic Variant Calling | ヒト 用

各種情報

Dovetail Analysis Portal ウェブサイト
(英語)

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