近接ライゲーションテクノロジーDovetail Genomics®

Dovetail® Micro-C キット

Dovetail® Micro-C キット 主な特徴

MNaseによる均一な断片化で超高解像度Hi-C

Micrococcal Nuclease (MNase) 消化で得られる非常に均一で短い断片により、ヌクレオソームレベルの最高解像度でクロマチンコンタクト情報の取得が可能です。

ロングレンジインタラクション情報のキャプチャ

TAD、ループ解析などのエピジェネティクス研究を更に向上します。

ヌクレオソームポジションのキャプチャ

ユークロマチン/ヘテロクロマチン領域を検出することが可能です。

わずか2日間、5ステージのシンプルなワークフロー

これからクロマチン構造解析を始める方にも最適です。

ヌクレオソームポジションとクロマチンインタラクションを、1つのライブラリで

豊富なヌクレオソーム保護フラグメントによりゲノム全体でヌクレオソームレベルの高解像度

従来の制限酵素ベースの手法では、制限酵素サイト密度が低い領域ではカバレッジがなく、全く情報を捉えることができませんが、Micro-Cのライブラリはヌクレオソームの周期性を高解像度に捕捉することが可能です。

コンタクトマトリクスのS/N比を向上させ、より高解像度な検出が可能

Micro-C、シングルRE、マルチRE Hi-Cのコンタクトマトリクスの比較

既知のループを丸で囲み、各ライブラリタイプのサポートリード数を示していますが、Micro-Cは従来のREベースのHi-Cと比較して、ループの検出力が大きく向上しています。

ヌクレオソームレベルの高分解能をもつクロマチンコンタクト情報

Micro-C(A)とマルチRE Hi-C(B)のCTCF周辺のコンタクトマトリクス

Micro-Cでは、CTCF周辺のヌクレオソームのフェージングとヌクレオソーム間の相互作用の両方が明瞭に観測できます。

製品仕様

Dovetail® Micro-C Kit
カタログ番号 #21006
製品内容 ライブラリ調製キット、8反応分、ほ乳類細胞で検証済み
Dovetail® Library Module for Illumina 8Rx
カタログ番号 #25004
製品内容 ライブラリモジュール、8反応分
Dovetail® Dual Index Primer Set #1 for Illumina 8Rx
カタログ番号 #25010
製品内容 プライマーセット、8反応分

各種情報

技術資料

Dovetail Genomics ウェブサイト(英語)

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